基于全基因組的番茄YUCCA基因家族生物信息學(xué)分析.pdf
YUCCA基因是植物在合成生長素過程中限速酶的編碼基因,植物生長發(fā)育離不開生長素,也同樣離不開YUCCA基因。為深入研究番茄中的YUCCA基因,本研究利用生物信息學(xué)方法,在番茄全基因組范圍內(nèi)共鑒定出了17個(gè)YUCCA基因,并對(duì)17個(gè)YUCCA基因的基本信息、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)、保守基序、順式元件、染色體定位、系統(tǒng)發(fā)育以及表達(dá)模式進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,17個(gè)YUCCA基因分布在7條染色體上,并且可以分為三大類A、B、C。YUCCA基因的內(nèi)含子在0到7之間分布。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,同一條染色體上的YUCCA基因有明顯的進(jìn)化關(guān)系。通過以上分析,對(duì)后續(xù)深入研究番茄YUCCA基因家族提供了參考。