遼寧省主要設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地大棚土壤ARGs與MGEs分布特征分析.pdf
收稿日期 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 基金項目 國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目 nullnullnullnullnullnullnullnullnull 東北粳稻遺傳改良與優(yōu)質(zhì)高效生產(chǎn)省部共建協(xié)同創(chuàng)新中 心專項資金項目 nullnullnullnullnullnull nullnullnull 黑土地保護(hù)與利用科技創(chuàng)新工程專項 nullnullnullnullnullnullnull 作者簡介 張 null 珣 nullnullnullnullnull 男 遼寧沈陽人 博士 副教授 第 nullnull 卷第 null 期 nullnullnullnullnullnullnull 年 nullnull 月 沈 陽 大 學(xué) 學(xué) 報 自 然 科 學(xué) 版 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 文章編號 nullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 遼寧省主要設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地 大棚土壤 與 分布特征分析 張 null 珣 null null 武 null 軼 null 黎馨月 null 王百羽 null 安 null 婧 null 王 null 瑩 null nullnull沈陽大學(xué) 環(huán)境學(xué)院 遼寧 沈陽 nullnullnullnullnullnullnull nullnull沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 東北粳稻遺傳改良與優(yōu)質(zhì)高效生產(chǎn)省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心 遼寧 沈陽 nullnullnullnullnullnullnull nullnull中國科學(xué)院 沈陽應(yīng)用生態(tài)研究所 遼寧 沈陽 nullnullnullnullnullnullnull 摘 nullnullnull 要 為分析設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地大棚土壤中抗生素抗性基因 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull 污染與 可移動基因元件 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull 的分布特征 于遼寧省 null個主要設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地采集溫室 大棚土壤樣品進(jìn)行實(shí)驗分析 由于長期施用畜禽糞肥 致使土壤中 nullnullnullnull的相對豐度和多樣性顯著增加 對采樣點(diǎn)的土壤進(jìn)行 nullnullnullnull及 nullnullnullnull種類和豐度的檢測 并對其相關(guān)性進(jìn)行分析 結(jié)果表明 土壤樣品中檢 測出 nullnull種 nullnullnullnull和 nullnull種 nullnullnullnull 其中 nullnullnullnull nullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull以及 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull的檢出率 為 nullnullnullnull 且抗性機(jī)制主要為細(xì)胞保護(hù) 土壤中部分 nullnullnullnull的相對豐度與 nullnullnullnull的相對豐度之間存在一定的 正相關(guān) 關(guān) null 鍵 null 詞 設(shè)施農(nóng)業(yè)土壤 抗生素抗性基因 可移動基因元件 抗性機(jī)制 分布特征 中圖分類號 nullnullnull nullnullnull 文獻(xiàn)標(biāo)志碼 null nullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null null nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull DOI 10 16103 ki 21 1583 n 2023 03 006 nullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 抗生素主要是由細(xì)菌 霉菌或其他微生物產(chǎn)生的次級代謝產(chǎn)物或人工合成的類似物 近年來 獸用 抗生素在過度醫(yī)療和畜牧業(yè)領(lǐng)域的濫用 導(dǎo)致環(huán)境中抗生素殘留激增 耐藥細(xì)菌出現(xiàn) 越來越多的抗生 素和抗生素抗性基因 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull 的出現(xiàn)和擴(kuò)散對抗生素的治療效果和生態(tài)環(huán) 境的穩(wěn)定造成了嚴(yán)重危害 nullnullnullnull 作為 null 種新環(huán)境污染物于 nullnullnullnull 年被正式定義 null 近年來受到大眾的關(guān)注度愈來愈高 土壤 中 nullnullnullnull 主要來源于土壤微生物及人或動物的糞便等 其中動物糞便為 nullnullnullnull 進(jìn)入土壤的主要途 徑 nullnullnull 研究表明 錢勛 null 在雞糞中檢出 nullnullnull 種 nullnullnullnull 在豬糞中檢出 nullnullnull 種 nullnullnullnull 在牛糞檢出 nullnull 種 nullnullnullnull nullnullnullnull 等 null 在豬 雞 牛等 null 種畜禽糞便中檢測到 nullnullnull 余種 nullnullnullnull 張丹等 null 在雞糞和牛糞中檢測 到 nullnullnullnull 和可移動遺傳元件 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull 在長期施用畜禽糞便的土壤中 nullnullnullnull 的豐度和多樣性會顯著增加 null nullnullnullnull 等 null 研究表明 施用雞糞商業(yè)有機(jī)肥可顯著增加土壤中 nullnullnullnull 的 相對豐度 程建華等 null 在養(yǎng)牛場 養(yǎng)雞場和養(yǎng)豬場的土壤樣品中分別檢測到 nullnull nullnull 和 nullnull 種 nullnullnullnull 而 土壤中的 nullnullnullnull 可以向水體和農(nóng)作物中遷移 并隨食物鏈向動物及人類傳播 nullnull nullnullnullnull 通常位于質(zhì)粒 nullnullnullnullnullnullnull 轉(zhuǎn)座子 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 及整合子 nullnullnullnullnullnullnullnull 等可移動遺傳元件 nullnullnullnull 上 可以通過基因水平轉(zhuǎn)移發(fā)生遷移 引起抗生素耐藥菌的擴(kuò)散 nullnull nullnullnullnull 主要為整合子 質(zhì)粒 轉(zhuǎn)座 子等 其中整合子位于質(zhì)粒和染色體上 是 nullnullnullnull 轉(zhuǎn)移的重要分子元件 nullnull 程建華等 null 研究表明 養(yǎng)殖 場土壤中較高的 nullnullnullnull 豐度及 nullnullnullnull 豐度呈顯著的相關(guān)性 nullnullnullnullnull 張俊華等 nullnull 研究表明 磺胺類 氯霉素類 氨基糖苷類 nullnullnullnull 和 nullnullnullnull 總和與 nullnullnullnull 均呈極顯著正相關(guān) 說明 nullnullnullnull 可能促進(jìn)了 nullnullnullnull 在土壤環(huán)境中的遷移擴(kuò)散 本文利用超高通量熒光定量 nullnullnull 儀對遼寧省主要設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地大棚土壤的 nullnullnullnull 與 nullnullnullnull 進(jìn) 行研究 分析設(shè)施農(nóng)業(yè)土壤中 nullnullnullnull 和 nullnullnullnull 的分布特征及相關(guān)性 null 材料與方法 null 土壤樣品采集 選取遼寧省內(nèi)的主要設(shè)施農(nóng)業(yè)集散地溫室大棚作為采樣點(diǎn) 每個采樣點(diǎn)采集 null 份重復(fù)樣品 采樣深 度為 nullnullnullnullnullnull 土壤過 nullnullnull 篩并保存于超低溫冰箱中 用于后續(xù) nullnullnull 提取和 nullnullnullnull 的測定 樣品 的基本信息如表 null 所示 表 null 不同采樣點(diǎn)土壤樣品基本信息 null null null null null null null null null 采樣點(diǎn) 樣品編號 種植蔬菜種類 經(jīng)緯度 null 經(jīng)度 緯度 nullnullnull質(zhì)量濃度 nullnull null null nullnull 朝 null 陽 null 菠菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull 莊 null 河 null 菠菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull 遼 null 中 null 油菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull 興隆臺 null 油菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull 沈 null 北 null 大白菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull 新 null 民 null 大白菜 nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnull null 的提取 使用新鮮土壤樣品 nullnullnullnull 用于 nullnullnull 提取 使用土壤 nullnullnull 基因組提取試劑盒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 美國歐米茄公司生產(chǎn) 從土壤樣品中提取 nullnullnull 按照說明書的要求進(jìn)行提取 nullnullnull 提取完 nullnullnull 沈陽大學(xué)學(xué)報 自然科學(xué)版 nullnullnullnullnullnullnullnull 第 nullnull 卷 畢后 null使用超微量光度分析儀 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnull null德國 nullnullnullnullnullnull 公司生產(chǎn) null測定其 nullnullnull 的純度 和質(zhì)量濃度 null nullnullnullnull null nullnullnullnull 在 nullnullnullnullnull 之間 null表明 nullnullnull 純度可進(jìn)行后續(xù)的分析 null null 高通量熒光定量 null 定量檢測 抗生素抗性基因檢測采用超高通量熒光定量 nullnullnull 系統(tǒng)完成 null該系統(tǒng)每次能夠并行 nullnullnullnullnull 個納升級 nullnullnullnull 反應(yīng) null其中共設(shè)置了 nullnull 對引物 null其中包括 null 對 nullnullnullnullnullnullnull 內(nèi)參引物 null null 個轉(zhuǎn)座酶 null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull null 個整合子和 nullnull 個靶向 nullnullnullnull null實(shí)現(xiàn)快速準(zhǔn)確地檢測各類環(huán)境介質(zhì)中 nullnullnullnull 的多樣性和豐度信息 null nullnullnull 反應(yīng)混合液先使用納升級多樣品點(diǎn)樣儀加入到微孔芯片中 null隨后進(jìn)行 nullnullnullnull 反應(yīng) null反應(yīng)程序為 nullnullnull 預(yù) 變性 nullnullnullnullnull null然后進(jìn)行 nullnull 個循環(huán)的擴(kuò)增階段 nullnull nullnullnull null nullnullnull null nullnullnull null nullnullnull null nullnull 次循環(huán) nullnull nullnullnullnull 結(jié)果使用儀 器的 nullnullnullnull 軟件進(jìn)行自動分析 null nullnullnullnullnull 設(shè)為檢出域 null null 個重復(fù)中有 null 個及以上檢出 null偏差 nullnullnullnull null且滿 足曲線擬合分析的則判為檢出 null null 統(tǒng)計分析 采用 nullnullnullnullnull 分析 nullnullnullnull 和 nullnullnullnull 的組成特征 null采用 nullnullnullnull 對 nullnullnullnull 在土壤中遷移傳播擴(kuò)散與 nullnullnullnull 的相關(guān)性進(jìn)行分析 null null 結(jié)果與分析 null 設(shè)施農(nóng)業(yè)土壤 與 的種類和數(shù)目 土壤 樣 品 中 檢 測 到 nullnull 種 nullnullnullnull 和 nullnull 種 nullnullnullnull null nullnull 種 nullnullnullnull 為 null 個 氨 基 糖 苷 類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull null 個 多 重 耐 藥 類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull null 個 null null 內(nèi) 酰 胺 酶 類 null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull null 個 氯 霉 素 類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnull 個 大 環(huán) 內(nèi) 酯 類 null nullnullnullnull nullnull null 個 磺 胺 類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnull 個 四 環(huán) 素 類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull null 個喹諾酮類 null nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull其中 null null 內(nèi)酰胺酶抗生素抗性基因 nullnullnullnullnullnull null nullnullnullnull null大環(huán)內(nèi)酯 類抗生素抗性基因 nullnullnullnull null nullnullnullnull null nullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null磺胺類抗生素抗性基因 nullnullnullnull null nullnullnullnullnull null nullnullnullnull null四環(huán)素類 抗生素抗性基因 nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnull 和喹諾酮類抗生素抗性基因 nullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull 的檢出率是 nullnullnullnull null檢測到的 nullnull 種 nullnullnullnull 可移動基因元件為 null 種類型整合子和 null 種類 型轉(zhuǎn)座酶 null其中整合子 nullnullnullnullnullnull 和轉(zhuǎn)座酶 nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull 的檢出率為 nullnullnullnull null 土壤 nullnullnullnull 與 nullnullnullnull 數(shù)目分析如圖 null 所示 null新民土壤樣品 null 的 nullnullnullnull 和 nullnullnullnull 檢測到的數(shù)目是 最高的 null nullnull 個 nullnullnullnull